대전광역시의회는 9월 12일 기자회견을 하면서 수도권 소재 공공기관의 지방 이전 계획을 150만 대전 시민과 함께 진심으로 환영하나 "대전과 충남은 혁신도시 지정에서 제외되어 공공기관 이전대상지역에서 철저히 소외되는 등 상대적 역차별을 받았다"고 주장하였다.  

또한, 최근 확정된 내년도 정부예산안에 과학벨트 예산 1753억원이 대폭 삭감되는 등 대전에 대덕특구가 위치하고 있는 이점을 충분히 살리지 못하고 있는 상황에서 혁신도시로 지정받지 못한 것은 더욱 안타까운 실정으로 수도권을 제외한 지역에서 「혁신도시 건설 및 지원에 관한 특별법」의 적용을 받는 "'지방 이전 공공기관이 1곳도 없는 지역은 대전이 유일하다"고 지적하였다.

공공기관 추가 지방이전 계획을 추진함에 있어 「국가균형발전특별법」과 「혁신도시 건설 및 지원에 관한 특별법」의 개정을 통해 공공기관 이전 대상지역을 재점검하고 혁신도시 지정지역을 확대·조정하여 균형 잡힌 이전을 통해 지역의 혁신역량을 제고하고 지방세수 증가 및 지역경제 활성화를 도모하여야 한다고 촉구하였다.

대전광역시의회는 150만 대전시민의 뜻을 모아 공공기관 지방이전을 추진함에 있어 상대적 박탈감과 소외감이 발생하지 않도록 지역의 균형과 형평을 충분히 고려한 배분이 반드시 이루어질 것을 강조하였다